Park Krajobrazowy Puszczy Knyszyńskiej położony jest na terenie jedenastu gmin:

Gródek - 14 543,85 ha
Czarna Białostocka - 15 384,19 ha
Szudziałowo - 12 765,36 ha 
Supraśl - 12 585,98 ha
Wasilków - 3 900,74 ha                                
Dobrzyniewo Duże - 3 552,12 ha
Sokółka - 3 037,50 ha;
Janów - 1230,05 ha;
Knyszyn - 2 645,57 ha;
Michałowo - 2 520,83 ha;
Krynki - 693,98 ha.

Tereny leśne administrowane są przez Państwowe Gospodarstwo Leśne "Lasy Państwowe", zarządzane przez siedem nadleśnictw: Czarna Białostocka, Dojlidy, Knyszyn, Krynki, Supraśl, Waliły, Żednia.